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醫院病理科分子病理實驗室實施方案
醫院病理科分子病理實驗室實施方案.doc
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施工專題
上傳人:地** 編號:1192096 2024-09-20 26頁 1.03MB

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1、-SEEPOO TECH*醫院病理科分子病理實驗室推薦方案目錄第一部分 分子病理概述31.1分子病理診斷的應用范圍51.2常用分子病理技術51.3 FISH-熒光原位雜交61.4部分FISH產品對比(廠家提供,僅供參考)71.5實時熒光定量PCR91.6 基因測序10第二部分 分子病理實驗室設施與環境11第三部分 病理科實驗室質量管理標準12第四部分 分子病理常用檢測設備131、熒光顯微鏡原位雜交圖像分析系統132、Leica Bond-Max全自動免疫組化和原位雜交多功能染色機133、羅氏LightCycler 480 模塊式高通量實時熒光定量PCR系統144、羅氏BenchMark GX 2、全自動多功能組織病理檢測系統155、Illumina HiSeq 2000高通量測序儀156、NatureGene TermoBrite 原位雜交儀167、力康HFsafe-1200 Class Type A2 生物安全柜178、Neofuge1600 Healforce 臺式高速冷凍大容量離心機18第五部分 分子病理實驗室推薦設備型號及預算19方案一 初級配置方案19方案二 專業性配置方案19方案三 科研型配置方案20第六部分 分子病理常用試劑及價格20第七部分 分子病理經濟效益分析257.1熒光原位雜交(FISH)檢測項目的經濟價值257.2 實時熒光定量PCR項目的經濟價值27第一部分 3、分子病理概述病理為醫之本 As is our pathology, so is our medicine器官病理學組織細胞病理學臨床病理免疫組化分子病理18-19世紀19世紀19世紀中葉取活體病變組織做病檢提高病理診斷準確性20世紀早期診斷、靶向治療20世紀手術切除組織標本病理檢測病理學發展過程分子病理學中常用的分子生物學技術主要有核酸分子雜交、PCR相關技術、免疫熒光化學、基因芯片以及DNA序列分析等。由于分子病理學的應用,使得我們對疾病本質的認識更加深化,對于腫瘤的診斷和治療也取得很大的進展。主要表現在以下幾個方面:1、腫瘤易感基因的檢測:腫瘤遺傳相關的易感基因檢測對于腫瘤高危人群的篩檢具4、有實用價值,已明確的腫瘤易感基因及其相關腫瘤有Rb1(視網膜母細胞瘤)、WT1(腎母細胞瘤)等。除了檢測高危人群的易感基因外,有方法也應用于正常人群腫瘤易感性檢測,如檢測Ret基因突變用于診斷型多發性內分泌腫瘤,通過分析GST基因型以判斷個體暴露于致癌物時的致癌危險性等。2、腫瘤相關病毒的檢測:如HPV病毒與宮頸癌的發生有很大關系,通過對HPV病毒的檢測可起到預防和提早治療的作用。而當前國際上診斷HPV感染以DNA檢測為主。3、腫瘤的早期診斷:K-ras基因突變在結腸癌、胰腺癌和肺癌等腫瘤中發生率較高。應用細針穿刺活檢材料檢測胰腺癌的第12密碼子變突。應用PCR-RFLP方法檢測結腸癌患者糞便5、中的Ras基因突變,其檢出率與瘤組織中相似,可用于高危人群的篩選。4、疑難腫瘤的診斷和分類:傳統的病理學診斷主要通過形態學和免疫表型來判斷淋巴細胞增生與淋巴細胞性腫瘤,但對對醫生的經驗要求較高,且難度較大。應用RFLP分析免疫球蛋白或T細胞受體基因重排,具有鑒別診斷作用,且這種分子病理分型比免疫學分型更為準確。對Bcr區基因重排的檢測,可對慢性粒細胞性白血病和急性粒細胞性白血病進行鑒別診斷。N-myc和C-myc擴增和表達的檢測,對鑒別神經母細胞瘤和神經上皮瘤具有應用價值,因前者N-myc明顯擴增,而后者則為C-myc明顯擴增。 5、腫瘤的預后監測:利用癌癥患者的全基因序列開發出的個性化血液檢6、測方法有助于醫生調整癌癥患者的治療方案,可以監測癌癥治療后的情況以及發現癌癥是否復發。6、為腫瘤個體化和預見性治療提供依據:腫瘤在發生、發展的不同時期,可能涉及不同基因的不同變化形式,而這種變化與腫瘤臨床治療的敏感性密切相關,如能在分子水平對腫瘤基因變化提供指標,對腫瘤的個體化和預見性治療具有指導意義。如在90%的胰腺癌、50%的結腸癌、30%的非小細胞肺癌中存在Ras基因的激活,50%左右的腫瘤有P53基因不同形式的突變,這些基因的異常,使腫瘤對某些放療或化療的方法具有抵抗性,如能從基因水平上改變異常基因的狀態,則可提高放、化療的敏感性。 7、腫瘤的預后判斷:腫瘤基因的突變、擴增及過表達等改7、變常與腫瘤的預后密切相關。如HER2基因擴增與乳腺癌發生發展及臨床預后密切相關, HER2的陽性表達提示預后不良,可通過熒光原位雜交(FISH)技術進行檢測,配合術后治療,指導臨床用藥。組織病理學診斷免疫病理學診斷分子病理學診斷病理學診斷及鑒別診斷腫瘤“個體化”靶向治療斷藥物療效的評價臨床預后評估及預測1.1分子病理診斷的應用范圍n 人類遺傳病的基因診斷和產前診斷 n 腫瘤分子靶向治療 n 明確感染性疾病的病源體(細胞、真菌、病毒) n 多基因病研究 n 組織器官移植配型 n 輔助病理診斷 n 法醫學 n 性別鑒定 n 基礎研究通過PCR技術確認Ig和TCR基因是否發生重排,判定淋巴造血系統疾8、病的良惡性。FISH法檢測乳腺癌her-2基因是否發生擴增,指導臨床靶向藥物(赫賽汀)治療。FISH法檢測滑膜肉瘤SYT基因是否發生易位,協助臨床診斷。通過對結直腸癌KRAS基因的突變測序分析,指導靶向用藥(愛比妥)。HPV多亞型檢測,提示宮頸癌的發病風險。肺癌分子靶向治療 EGFR酪氨酸激酶抑制劑:吉非替尼(gefitinib, 商品名Iressa) 、埃羅替尼 (Erlotinib, 商品名Tarceva)檢測HER2狀態的臨床價值胃癌靶向治療患者篩選、療效預測 1.2常用分子病理技術免疫組織化學(IHC)技術檢測蛋白 分子原位雜交DNA,RNA 熒光原位雜交(FISH)技術DNA,RNA9、多聚酶鏈式反應PCR技術DNA,RNA 熒光定量PCRDNA,RNADNA測序技術DNA突變 生物芯片技術DNA,RNA,蛋白質等DNA印跡(Southern blot)微衛星不穩定檢測(MSI) 醫院病理科開展分子病理實驗項目,一般從實用出發,二級醫院主要開展熒光原位雜交(FISH)項目,三級醫院主要開展熒光原位雜交(FISH)、熒光定量PCR項目,有條件的三級醫院可以開展DNA基因測序項目。1.3 FISH-熒光原位雜交FISH技術是一種通過熒光標記的DNA探針與細胞核內的DNA靶序列雜交,在熒光顯微鏡下能原位顯示細胞核內雜交信號的分子細胞遺傳學技術。FISH技術檢測基因擴增的準確性比其他10、檢測技術高,可以避免由于染色體的多體而呈現的假陽性,被譽為“金標準”。實驗流程 FISH樣本的制備-探針的制備-探針標記-雜交-(染色體顯帶)-熒光顯微鏡檢測-結果分析FISH優點1.熒光探針商業化、采購方便、保存安全。2.實驗周期短、特異性好、定位準確。3.可定位1KB的DNA序列,靈敏度高4.一次染色可獲取24種不同顏色的染色體,對于隱匿性的缺失、異位診斷準確。FISH技術在醫院的運用 一切與染色體相關的科室。特別是病理科、血液科、婦產科、生殖中心(產前診斷、植入前診斷)等。目前應用于臨床檢測的FISH基因探針有接近于一百種。在美國,FISH探針已被FDA列為“特異性分析試劑”,不需批準即11、可用于臨床醫學檢測。所以,FISH檢測在國外應用非常廣泛和迅速。如Vysis、Cytocell等公司,其產品已遍布全球,但其價格較貴,嚴重阻礙了在我國國內的推廣。國內廠家,如金菩嘉和廣州安必平,近年來發展迅速,品種覆蓋范圍較廣,且產品質量保證、性價比高。并且,更為有利的是,國內公司供貨快速及時、售后服務好。由于國內廠家的崛起,近年來國內醫院開展FISH檢測的速度大大加快。FISH技術實驗室基本要求實驗室環境:樣本準備區、暗室(10-15平米左右);實驗設備:熒光顯微鏡以及熒光成像分析系統、水浴鍋、原位雜交儀、冰箱、離心機、恒溫箱辦公設備:電腦、打印機實驗耗材:FISH探針,進口如雅培、羅氏 細12、胞類探針:諸如血液病類,如白血病、淋巴瘤、骨髓瘤等。其次,產前診斷和產后篩查類;實體腫瘤類探針:病理科在檢測乳腺癌、子宮頸癌、膀胱癌、肺癌、宮頸癌、軟組織肉瘤、前列腺癌、甲狀腺癌等方面。技術人員:1人1.4部分FISH產品對比(廠家提供,僅供參考)品牌比較廣州安必平金菩嘉雅培(Vysis)探針種類覆蓋70種腫瘤探針,品種齊全,覆蓋了實體瘤及血液疾病。約40種,部分腫瘤沒有覆蓋。覆蓋70種腫瘤探針,品種齊全,覆蓋了實體瘤及血液疾病。探針質量用多個克隆標記探針,信號靈敏,背景低,質量與國外相當。實體瘤探針質量與國外相當,但血液病探針信號不佳。探針信號靈敏,背景低,質量好。價格由于有自己的研發團隊,13、探針都為自產,成本較低,具有強大的價格競爭力,本公司的出現也打破了國內公司一家獨大的壟斷。價格比雅培低,但高于安必平。由于異國操作,運營成本高,價格高。操作便利性即用型探針:探針溶液已包含雜交液組分,可直接點樣雜交,無需雜交前溶解探針和混勻探針及雜交液,方便操作和減少出錯。探針與雜交液分開,雜交前需在黑暗環境中混合兩者,操作不變、容易出錯。探針與雜交液分開,雜交前需在黑暗環境中混合兩者,操作不變、容易出錯。輔助試劑配送FISH所需的常規試劑(蛋白酶K或胃蛋白酶、NP-40、多聚甲醛、20SSC等),節約客戶采購時間及成本。搭配蛋白酶K一起銷售。搭配蛋白酶K、NP-40等一起銷售。熒光顯微系統配14、置從客戶出發,幫客戶選用性價比高的熒光顯微鏡及圖像分析軟件,操作便利,性價比高。滿足要求,但價格較高。滿足要求,但價格較高,且客戶可能需自己配置系統。顯微鏡明場觀察配相差功能,可鏡下仔細觀察蛋白酶消化狀態,對小體積樣本及珍貴樣本處理特別有效,避免消化不佳導致雜交結果不好。不配相差功能。不配相差功能。標配濾塊對新客戶標配四種顏色的熒光濾塊(DAPI、綠、紅、青),可同時滿足實體瘤及產前診斷。只標配三種顏色濾塊(DAPI、綠、紅),如需開展產前診斷的話客戶還要額外購買青色濾塊。只標配三種顏色濾塊(DAPI、綠、紅);如需開展產前診斷的話客戶還要額外購買青色濾塊,且需用到金色濾塊(容易出現竄色),濾15、塊配置要求太高。檢測靶標因為標配了四種濾塊,可同時檢測三個靶標(綠紅青),臨床檢測效率高、能降低試劑成本、且能應用于多靶標檢測的科研課題。只有兩個靶標的試劑(綠紅),靶向選擇及組合受限。有同時檢測三個靶標的試劑,但因為不是標配,應用受限。圖像分析軟件有自主研發的圖像分析軟件,降低客戶采購成本。外購。外購。品種設計因為所有探針都為自主研發,可為客戶靈活設計產品探針組成,以便臨床、科研充分使用及降低試劑成本探針不能根據客戶需求進行調整,可能存在試劑成本較高的風險。探針不能根據客戶需求進行調整,可能存在試劑成本較高的風險。特色產品能設計多個“二合一”探針組合;15種微缺失探針(用于流產原因篩查及其他16、少見綜合癥);只有部分基因探針。不能根據客戶需求設計“二合一”探針。國內SFDA證書兩個產品取得注冊受理號,即將取得注冊證書。幾個產品取得注冊證書。兩個產品取得注冊證書。地理位置位于廣州,華南地區客戶地理位置近,送貨及服務及時到位。位于北京,華南地區服務不便。位于國外,國內雖有代理,但售后服務及技術支持不能最快反應。平臺支持有多年其他產品的網絡支持,如病理科中的液基細胞學平臺,與客戶建立了多年來的良好關系。產品單一,只有FISH試劑,設備、人員投入高。有其他試劑,但病理科中只有FISH,無其他平臺支持。售后服務借助于廣泛的液基細胞學網絡及合作公司達安基因的全國網絡,售后服務迅速周到。售后服務網17、絡單一,售后服務風險較高。售后服務網絡單一,售后服務風險較高。優勢資源與達安基因合資,充分利用全國廣泛的銷售及技術支持資源。特殊資源有自己的學術核心期刊分子診斷與治療,方便客戶課題研究。無無1.5實時熒光定量PCR實時熒光定量PCR技術,是指在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監測整個PCR進程,最后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。臨床疾病診斷:各型肝炎、艾滋病、禽流感、結核、性病等傳染病診斷和療效評價;地中海貧血、血友病、性別發育異常、智力低下綜合癥、胎兒畸形等優生優育檢測;腫瘤標志物及瘤基因檢測實現腫瘤病診斷;遺傳基因檢測實現遺傳病診斷。實時熒光定量PCR分子病理18、診斷應用 絕對定量(Absolute Quantification) 病原體檢測(HiV,HBV,結核桿菌,H1N1等) 基因表達研究(白血病融合基因表達檢測) 相對定量(Relative Quantification) 腫瘤組織中的特定基因表達(EGFR,VEGFR,BRCA1&2,ERCC1&2,RRM1) 腫瘤Bio-Marker特定miRNA檢測1900多個試劑盒 CNV研究超過160萬個TaqMan Copy Numer Assay 藥物療效考核 突變分型(Allelic Discrimination) 基因突變分析-腫瘤個體化醫療 SNP研究2600 個藥物代謝試劑盒,個體化醫療 19、物種鑒定、菌株鑒定 陰陽性檢驗(Plus/Minus with IPC) 稀有突變檢測(早期腫瘤診斷:外周血痕量腫瘤細胞等熒光定量PCR顯著優點 (1)、可以進行準確的定量檢測,可適用于基因診斷的各種疾病; (2)、定量范圍極寬,樣品無需做梯度稀釋; (3)、特異性更強,克服了假陽性的主要來源; (4)、操作快速,無需PCR后處理; (5)、技術簡單,易于學習和掌握; (6)、安全,對操作員和環境都無危害。 (7)、易于進行電腦化操作和數據管理,有利于醫院的現代化建設。實時熒光定量PCR檢測腫瘤的有關項目 CEA mRNA、 AFP mRNA、uPA mRNA、CK19 mRNA、CK20 m20、RNA、 MDRI mRNA。1.6 基因測序DNA 測序技術主要依據 Sanger 的雙脫氧鏈終止法。以 DNA 單鏈為模板,在特定條件下,用特異的引物在測序級 DNA 聚合酶的作用下,根據堿基互補配對原則,不斷將 4 種脫氧核糖核苷酸 (dNTP) 加到引物的 3- 羥基末端并使引物鏈得到延伸。將測序結果用DNA sequencing analysis 5.1軟件自動分析原始測序數據,獲取測序電泳圖和序列圖。臨床基因測序檢測對病理科的形態診斷金標準含金量的提升和分子病理技術的開發及經濟效益改善有現實意義。對于可疑癌前病變患者可以明確其病變標本是否真正含有候選基因的突變,以解除大量由免疫組化21、標記癌基因陽性患者的心理恐慌和經濟負擔。對癌癥家族有血緣關系的親屬檢測相關癌基因突變或多態性,具有亞健康診斷和體檢意義。第二部分 分子病理實驗室設施與環境1、布局合理、實驗室各區域的劃分;2、水電、照明、通風符合實驗室基本要求;3、消防設施齊全、消防通道暢通;4、石蠟組織、DNA樣本的存放;5、實驗室記錄、操作手冊等文件存放;6、實驗室耗材、試劑的存放;7、安裝生物安全防護設施;8、廢棄物的處置9、實驗室的清潔與日常消毒、并有相關記錄其中:PCR實驗環境要求明確分區,一般分為4個工作區;各區獨立,互不相通;設置緩沖間,設置傳遞窗;單一方向FISH實驗環境要求:需要避光獨立的暗室,專門的熒光顯微22、鏡觀察室第三部分 病理科實驗室質量管理標準1、衛生部【2009】31號文件病理科建設與管理指南(試行)2、2006年6月1日實施的醫療機構臨床實驗室管理辦法3、全國各省市的關于臨床病理專業質量檢查及評價標準4、美國CAP認可標準5、歐洲NordiQC認證標準6、國際標準化組織制定并于2003年正式發布醫學實驗室的管理標準:ISO15189:2003醫學實驗室質量和能力的專用要求,由國際實驗室認可合作組織(ILAC)推薦執行。適合臨床多學科實驗室對檢驗前、中、后全過程的管理。第四部分 分子病理常用檢測設備1、徠卡Leica熒光顯微鏡原位雜交圖像分析系統 品牌/型號:LEICA DM 2500 技23、術參數一、熒光顯微鏡部分1、配顯微鏡主機2、光學系統:無限遠校正光學系統。3、具有明場、熒光觀察功能。4、6位物鏡轉換器。5、總放大倍數:50X-1000X。6、*三目觀察鏡筒,分光比例:100%/0,50%/50%,0/100%7、透射光照明:12V100W鹵素燈。8、底座帶濾片架和日光濾光片。9、*單手操作樣夾, 方便同時記錄。10、*調焦與X-Y調節全對稱, 實現無疲勞操作。11、*調焦旋鈕高度可調12、*3步聚焦(粗/中/細),鈕距可調,停焦可調。13、*聚光鏡:帶與物鏡放大倍數相匹配的孔鏡光欄彩色標記, 方便聚光鏡調節14、超硬鍍陶瓷載物臺 15、*載物臺調節左右手可以更換。16、X24、-Y移動無暴露齒條。17、配平場半復消色差物鏡:1.25x(NA=0.04),平場半復消色差熒光物鏡10x(NA=0.30),平場復消色差熒光物鏡63x(NA=1.30)oil,平場半復消色差熒光物鏡100x(NA=1.30)oil。18、目鏡:10X寬視野目鏡,視野數為25mm;19、熒光裝置:5位熒光濾塊轉換器,配紫外、藍色、綠色熒光激發。UV 激發: 激發340-380nm; 阻擋400nm; 發射: 425nm;Blue激發:激發480/40nm; 阻擋505nm; 發射: 527/30nm;Green激發:激發546/12nm; 阻擋565nm; 發射: 600/40nm20、外置熒25、光光源:外置金屬鹵化物光源,長壽命,免調節工作時間2000小時以上。光源通過光纖傳輸,無熱力傳輸。 21、*有熒光“零像素點漂移”技術。22、*有光陷設計可以確保有很黑的背景:傾斜的發射光濾塊,吸收雜 光的黑色涂層,磨光表面和減少反射的涂層。23、配1 x接口二、數碼成像系統部分:配高靈敏度雙速單色冷CCD數碼攝像頭參數,半導體式制冷,-20度。 2/3英寸CCD,像素1392 x 1040(1.4 Mpixel),像素大小6.45x6.45um pixels,感光面積8.9 * 6.6 mm。三、細胞染色體核型及熒光原位雜交分析軟件 1、CytoVision karyotyping染色體核型26、及熒光原位雜交分析1.1、有完備的染色體圖象處理技術,對染色體之間的重疊交叉和連接等都可用單鍵自動分割或手動畫線分割,劃線切割時畫錯可以任意后退回擦;1.2、畫中軸線分離染色體時,不同染色體自動用不同顏色突出;1.3、可對顯帶不夠清晰的染色體應用不同的高斯數陣顯示格式使條帶明晰;1.4、染色體放大、縮小、旋轉、翻轉、鏡向翻轉;1.5、可自動或人工干預識別著絲粒位置,可自動或手動將染色體拉直1.6、可以創建用于自己染色體樣品的分類體系以增加分類的精確性,也可以對已有的分類器進行訓練,使之與分析對象更匹配1.7、快速校正錯放和未識別的染色體1.8、可以編輯定義染色體標準模式圖1.9、強大的(CAS27、EVIEW)功能,可對捕獲的中期相圖進行分類標記,可根據需要選擇不同的中期相分別進行核型分析、染色體數目直接計數和中期染色體直接標記1.10、強大的多細胞平行比較(MULTICELL)功能,方便比較同一或不同玻片上的同一號染色體的差異1.11、強大的主任管理(DIRECTOR REVIEW)功能,方便和復查相關病例的核型結果;1.12、可識別G、R、Q、C、DAPI的顯帶分型,G帶有300、400、550、700、850條帶的分類標準、R帶有400、550條帶的標準;1.13、強大的實驗室管理、質量控制和數據統計功能,可追蹤染色體分析的數量,可對各種不同類型病例進行分類統計。2、CytoVis28、ion FISH熒光原位雜交分析模塊2.1、多通道顏色采集,不限數量2.2、可以識別出DAPI和PI染色的染色體分帶細節2.3、可對FISH圖像的探針信號對比度調節2.4、可對部分選擇對目標信號單獨修飾2.5、有對信號的感興趣區采集功能2.6、可用于探針標記和G-帶染色體比較2.7、可計算FISH信號的強度面積距離等2.8、可測量P端長度比(FLPTER)值2.9、可對中期FISH圖中的信號進行定位2.10、可對中期FISH圖進行染色體分割排列2.11、核型圖可顯示為反轉黑白條帶(與G帶帶紋匹配)2.12、FISH核型圖可顯示為彩色熒光圖2.13、彩色熒光信號可明確顯示位于哪條染色體具體什么位29、置2.14、強大的捕獲中和鋪貨后圖像處理功能(除常規GAMMA、對比度、銳化柔化、消除等等功能外,還可以使用多種高斯數陣改變圖像顯示方式)2.15、可手工直接對間期細胞進行分類標記,然后自動統計每一類細胞的數量和百分比2.16、可在FISH圖像上添加文字和圖譜2.17、可與染色體標準模式圖或核型圖比較2.18、可與染色體核型圖出在一張報告上;2.19、Z軸分層采集:每種熒光素獨立設置不同參數,分別進行分層采集,然后自動合彩色圖像,層間距根據細胞大小靈活設置,層數根據目標厚度靈活設置,探針大小可靈活設置,克服了熒光信號不在同一焦平面上倒置部分信號虛化或缺失的問題,使FISH信號點數清晰可數,使F30、ISH圖像漂亮美觀2.20、熒光點分類計數:自動搜索間期細胞、定位間期細胞、自動采集、統計每個間期細胞上不同熒光信號數量,統計融合信號,統計不同類細胞數量和百分比,可在掃描捕獲中使用z軸分層采集3、原裝進口Dell電腦, Windows 7 控制系統; 22” LCD 顯示屏。選配:建議核型加熒光原位雜交一起購買這樣對用戶老師使用范圍更廣,含蓋的面就比較全,如細胞中期和間期的熒光原位雜交都可以觀察,而且精度就會很高。2、Leica Bond-Max全自動免疫組化和原位雜交多功能染色機Bond-Max是一臺性能卓越的全自動免疫組化染色機,免疫組化的所有步驟-烤片、脫蠟、抗原修復、阻斷、標記一炕、31、標記二抗、顯色直到復染-都可以由Bond-Max自動完成,每個Bond-Max有3個玻片盤,同時最多可容納30張玻片,而每個玻片盤可獨立執行不同程序3、羅氏LightCycler 480 模塊式高通量實時熒光定量PCR系統超過10年的實時定量PCR系統與試劑研發的豐富經驗,凝聚成今日業界的經典之作。先進Therma-BaseTM 熱循環技術和改良光路設計確保檢測均一性,徹底消除邊緣效應。可以進行高分辨率熔解曲線分析的模塊式高通量熒光定量PCR系統。配合LIMS系統及自動進樣機械臂可實現遠程控制和自動化運作。準確度高動力學范圍廣,可檢測到100 -1010 個拷貝DNA。重復性高,CV0.15%32、。高重復性,孔間溫度均一性可達 0.1 高分辨率,輕松區分1000與2000拷貝模板濃度差異。靈活96孔、384孔熱循環模塊用戶自助更換。熒光染料和試劑完全開放。5個激發通道,6個檢測通道,支持多種檢測模式。可廣泛應用于絕對定量、相對定量、產物鑒定、終點法基因分型、熔解曲線基因分型、Micro RNA研究、DNA甲基化研究、HRM基因掃描等研究。高速反應時間(40個循環):384孔40分鐘,96孔60分鐘。4、羅氏BenchMark GX 全自動多功能組織病理檢測系統柔性自動化使IHC、ISH和FITC載片的所有制備步驟實現完全自動化;可單獨或同步處理IHC、ISH和FITC檢測。靈活優化臨床33、研究方案可選擇您自己的原抗體,也可選擇Ventana提供的即用型抗體可根據您的比容量/通量要求選擇一個或多個BenchMark一觸式雙色方案染色自動烤片一流技術自動烤片自動脫蠟自動細胞調節自動染色5、Illumina HiSeq 2000高通量測序儀HiSeq 2000測序涉及生物學各領域,包括DNA測序、RNA測序、宏基因組測序、甲基化測序、外顯子捕獲測序、ChIP-Seq等。因此,HiSeq 2000能夠為基因調控分析、轉錄組分析、SNP位點、結構變異分析和疾病分析等提供迅捷、龐大、準確的信息數據。6、NatureGene TermoBrite 原位雜交儀 一次可進行12張切片的實驗反應艙34、密封禁閉,溫度適宜精確的溫控,溫室均勻一致三種固定運行模式四十種自定義編輯程序數字鍵盤操作,方便易行 TermoBrite是原位雜交領域的領航者,其優質的性能在廣大原位雜交用戶中得到好評。嚴格溫度控制 溫差在設定溫度1 超強的溫度均一性 不受切片數量影響 理想的溫度控制 簡單程序設置 40種使用者自定義的程序 3種已設置運行模式 顯示屏隨時顯示實驗條件,實驗過程一目了然 尺寸146mm228mm451mm重量8.5kg容量12張玻片功率240VAC1.6A處理時間可持續0-100小時溫度控制溫度范圍30-99環境溫度5-407、力康HFsafe-1200 Class Type A2 生物安全柜35、Heal Force做為中國最早和最權威的生物安全柜品牌之一,一直憑借優異的產品品質、良好的用戶口碑和專業的售后服務品質深得全球100多個國家用戶的肯定,是中華人民共和國醫藥行業YY0569-2005生物安全柜產品標準的主要起草單位。Heal Force 品牌生物安全柜在中國各級疾病控制中心、醫院臨檢系統和科研院所系統是廣大科研工作者進行生物安全研究的重要防護屏障。8、Neofuge1600 Healforce 臺式高速冷凍大容量離心機HEAL FORCE是中國唯一一家同時獲得德國TUV ISO9001質量管理體系認證和歐盟CE產品質量認證的離心機品牌,全系列產品獲得中國SFDA認證的品牌,是36、全球首家采用“Strong-Drive”驅動軸技術、真正掌握膨脹閥反饋調節制冷技術以及離心機轉子硬質陽極氧化處理工藝的離心機品牌,采用德國的工藝技術,優質的售后服務,多年的客戶好評,保證了絕對的市場占有率。Heal Force Neofuge 15臺式高速離心機 最高轉速 16000rpm最大容量 4100ml最大離心力 24900g驅動系統 無碳刷變頻電機溫度控制范圍 1040/-溫度控制精度 1時間設定 9h59min內重量 79/58 Kg外形尺寸(長寬高) 580520315mm 第五部分 分子病理實驗室推薦型號及預算方案一 初級配置方案序號設備品牌 型號單價數量金額備注01熒光顯微鏡37、成像分析系統奧林巴斯BX41或者NIKONEclipse 50i或者國產3900001390000低端顯微鏡國產CCD熒光激發器國產軟件02恒溫加熱平臺常州菲普DB-3A型650016500高溫變性及烤片用03電熱恒溫水槽常州菲普SHA-CA型11000111000洗滌用04電熱恒溫培養箱上海精宏DNP-9052型460014600雜交用05生物安全柜上海力康HF safe900A22680012680006PCR擴增儀Hema 9600基因擴增儀47000147000合計485900(適合二級醫院,標本量少,常規檢測,不涉及科研)方案二 專業性配置方案序號設備品牌 型號單價數量金額備注01熒38、光顯微鏡成像分析系統德國LeicaDM250005700001570000生物顯微鏡 雙速單色冷 CCD5位熒光濾塊軟件CytoVision karyotyping02原位雜交儀美國StatSpinThermobrite8900017900003臺式高速離心機國產3200013200004實時熒光定量PCR凱杰Rotor-Gene Q 6plex360000136000005生物安全柜上海力康HFsafe-1200TE380001380001089000適合三級醫院病理科方案三 科研型配置方案序號設備品牌 型號單價數量金額備注01熒光顯微鏡成像分析系統德國LeicaDM40007500001739、50000智能顯微鏡高端配置02原位雜交儀美國StatSpinThermobrite8900018900003臺式高速冷凍離心機國產4000014000004實時熒光定量PCR羅氏LightCycler 4806800001680000最先進的PCR05生物安全柜上海力康HFsafe-1200TE3800013800006基因測序儀Illumina HiSeq 2000270萬1選配1597000適合綜合性醫院病理科,承擔科研項目。第六部分 分子病理常用試劑及價格序號名稱規格單位生產廠家中標價1丙肝病毒熒光定量檢測10人份盒中山大學達安基因760.00 2結核桿菌DNA-PCR20T(定量)盒40、中山大學達安基因760.00 3乙肝病毒PCR熒光定量20T(定量)盒中山大學達安基因760.00 4乙肝病毒PCR熒光質控低值300ul*7盒中山大學達安基因70.00 5BCR/ABL融合基因檢測試劑盒10人份盒北京金菩嘉醫療科技4520.00 6EGFR基因擴增檢測盒10人份盒北京金菩嘉醫療科技7000.00 7EGFR基因突變檢測盒10人份盒北京金菩嘉醫療科技4250.00 8HER-2 基因擴增檢測盒20人份盒北京金菩嘉醫療科技18000.00 9TOP2A基因異常檢測盒10人份盒北京金菩嘉醫療科技7000.00 10膀胱癌細胞染色體及基因異常10人份盒北京金菩嘉醫療科技10540.41、00 11子宮頸細胞TERC位點擴增10人份盒北京金菩嘉醫療科技3680.00 12kras基因突變檢測盒10人份盒北京金菩嘉醫療科技11800.00 13Vysis SS18 Break Apart FISH Probe Kit (CE)150ul+20ul包vysis12694.00 14N-MYC SpectrumGreen (2p24)/CEP 2 SpectrumOrange Probe150ul+20ul包vysis19231.00 15EWSR1 (22q12) Dual Color, Break Apart Rearrangement Probe 150ul+20ul包vysi42、s12681.00 161p36 / LSI 1q25 and LSI 19q13/19p13 Dual Color Probe 1000ul*2包vysis21023.00 17IGH/MYC, CEP 8 Tri-color, Dual Fusion Translocation Probe150ul+20ul包vysis12925.00 18IGH/MALT1 t(14;18)(q32;q21) Dual Color, Dual Fusion Translocation Probe , 20 uL150ul+20ul包vysis13124.00 19IGH/CCND1 Dual Color43、, Dual Fusion Translocation Probe150ul+20ul包vysis12925.00 20IGH/BCL2 Dual Color, Dual Fusion Translocation Probe (CE)200ul+200ul盒vysis12925.00 21TaqMan預混試劑盒200R盒ABI美國生物應用5170.00 FISH技術其他試劑及耗材編號說明編號說明試劑1二甲苯(脫蠟)2無水乙醇(脫蠟脫水、老化)3蛋白酶K(組織切片消化)4胃蛋白酶(細胞滴片消化)520SSC(預處理及洗滌)620PBS(配制蛋白酶K溶液、樣本處理)7SDS(配制蛋白酶K溶液)8N44、P-40(雜交后洗滌)9聚乙二醇1500(細胞保存液)10KCl(低滲液)11甲醇(固定液)12冰醋酸(固定液)13鹽酸(配胃蛋白酶溶液)14多聚甲醛(固定液)15NaOH(配多聚甲醛固定液)16MgCl2(配多聚甲醛固定液)17甲酰胺(洗脫液)18純化水或蒸餾水(配制溶液)耗材1防脫載玻片(經多聚賴氨酸或硅膠處理)2圓形玻璃染色缸3pH計及pH試紙(測量溫度)4蓋玻片(22mm22mm)5鑷子6橡皮膠(封片用,牙膏狀無刺激氣味)7雜交盒(鋁盒或鐵盒,平底)8蓋玻片(24mm50mm,玻片老化)9微量移液器一套(10、50、200、1000l)10絲綢布一塊(鋪蓋玻片用)11尖底離心管(50m45、l、15ml)12移液管13計時器14油鏡鏡油151.5ml/0.2ml/10l槍頭及相應槍頭盒16紗布若干(玻片老化,濕盒)17方形蓋子一個(玻片老化)18鉆石筆(標記組織切片位置)19鉛筆(玻片標記)20聚丙烯離心管(0.5ml/1.5ml)21離心管架(0.5ml/1.5ml第七部分 分子病理經濟效益分析7.1熒光原位雜交(FISH)檢測項目的經濟價值1、直接經濟價值:與各種實體腫瘤和血液腫瘤相關的FISH探針有接近100種,包括膀胱癌、乳腺癌、肺癌、宮頸癌、軟組織肉瘤、前列腺癌、甲狀腺癌等多種實體腫瘤;白血病、骨髓增生異常綜合癥(MDS)、多發性骨髓瘤(MM)、淋巴瘤等多種血液腫瘤。這46、些腫瘤探針已顯示出巨大的臨床應用價值。但由于該技術的先進性及國家法規出臺的相對滯后性,目前國家還沒有對FISH檢測項目有硬性收費標準的規定。如HER-2探針,國外廠家售價約2000元/人份,國內廠家約1100元/人份,而醫院收費約2500元/人份,具有一定的利潤空間。另外,國內獲得國家藥監局許可證(SFDA認證)的FISH試劑品種較少,絕大部分為沒有SFDA認證的FISH試劑(科研試劑)。而沒有SFDA認證的試劑采購成本價格要低于認證試劑很多,但是臨床收費兩者卻差不多。如乳腺癌中的TOP2A探針,其試劑售價約700元/人份,臨床收費可達2400元/人份。而目前國外國內的廠家絕大部分FISH探針47、都為科研試劑,特別是血液類探針。所以,FISH檢測項目約有100%的利潤空間,臨床檢測項目開展越多,利潤越大。本公司產品齊全,幾乎覆蓋了目前所有的用于臨床檢測的FISH探針,見附錄,選擇我們公司產品將有非常有利的效益空間。另外,我們產品具有后發優勢,根據目前的市場狀態,我們選擇最有利于客戶的產品來設計和研發,具有多個特色產品,方便客戶使用和降低試劑成本。如乳腺癌中HER-2和TOP2A兩個基因都具有用藥意義,但目前市場上只有這兩個基因單獨檢測的試劑,需要采購兩種試劑。而我們開發了可同時檢測HER-2、TOP2A及17號著絲粒探針的試劑,簡稱“二合一”,醫院只需采購一份試劑就能同時開單檢測兩個基48、因、收取兩份費用;且兩個探針在一起比較,消除了樣本處理的影響,結果更為可靠。同樣,在宮頸癌中,我們也有將TERC基因和c-MYC基因結合在一起檢測的試劑。另外,在多種腫瘤中,可根據客戶需要設計不同的探針組合,將極大地方便客戶使用和降低試劑成本,從而讓醫院具有更大的效益空間。2、間接經濟價值:由于FISH技術的先進性,醫院病理科或血液科或中心實驗室在開展過程中除了臨床收費這一直接的經濟價值外,還可在應用過程中將FISH技術用于特色科室的科研研究,發表文章,提升科室或醫院學術地位,獲得巨大的潛在價值。如前所述,FISH技術在國外研究較為全面,如HER-2基因,以FISH技術為實驗方法的文章就有上千篇,涉及與此基因相關的各種臨床研究。目前的FISH文章呈指數增長,說明此項技術應用的迅速擴大。具有豐富醫學病例的國內市場將是此項技術持續增長的下一熱點地區。并且,本公司的多種探針聯合檢測(如“二合一”),將更有利于國內醫院展開研究和發表文章。7.2 實時熒光定量PCR項目的經濟價值(略)-
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